年ESC房颤指南将瓣膜性房颤定义为，风湿性心脏瓣膜疾病（二尖瓣狭窄为主）与心脏瓣膜置换术后的房颤类型。年AHA/ACC/HRS房颤指南对非瓣膜性房颤定义为，在不合并风湿性二尖瓣病变、机械或生物瓣膜置换术，以及二尖瓣成形术的情况下，而出现的房颤。
之所以要区分瓣膜性房颤与非瓣膜性房颤，是因为两种房颤类型的血栓栓塞风险差异巨大。不合并瓣膜疾病的房颤，卒中发生率在每年2%~10%，而合并瓣膜疾病的房颤，卒中发生率则高达17%~18%。而且，心脏瓣膜疾病常与房颤伴发，据调查，63.5%的房颤患者伴有瓣膜异常，包括轻度瓣膜异常。这也决定了针对不同类型的房颤也应采取不同的抗凝策略。
目前指南推荐，非瓣膜性房颤患者根据CHA2DS2-VASc评分指导抗凝治疗；瓣膜性房颤患者血栓栓塞风险较高，推荐口服华法林抗凝。
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